Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SIX3O95343 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SIX3O95343 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SIX3O95343 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SIX3O95343 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SIX3O95343 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SIX3O95343 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SIX3O95343 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SIX3O95343 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SIX3O95343 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SIX3O95343 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SIX3O95343 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SIX3O95343 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SIX3O95343 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SIX3O95343 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SIX3O95343 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SIX3O95343 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SIX3O95343 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SIX3O95343 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SIX3O95343 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SIX3O95343 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SIX3O95343 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SIX3O95343 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SIX3O95343 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SIX3O95343 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SIX3O95343 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SIX3O95343 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SIX3O95343 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SIX3O95343 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SIX3O95343 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SIX3O95343 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SIX3O95343 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SIX3O95343 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SIX3O95343 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SIX3O95343 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SIX3O95343 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SIX3O95343 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SIX3O95343 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SIX3O95343 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SIX3O95343 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SIX3O95343 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SIX3O95343 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SIX3O95343 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SIX3O95343 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SIX3O95343 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SIX3O95343 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SIX3O95343 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SIX3O95343 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SIX3O95343 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SIX3O95343 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SIX3O95343 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SIX3O95343 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SIX3O95343 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SIX3O95343 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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