Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
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