Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCAO15360 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCAO15360 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCAO15360 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCAO15360 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCAO15360 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCAO15360 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCAO15360 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCAO15360 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCAO15360 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCAO15360 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCAO15360 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCAO15360 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCAO15360 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCAO15360 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCAO15360 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCAO15360 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCAO15360 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCAO15360 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCAO15360 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCAO15360 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCAO15360 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCAO15360 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCAO15360 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCAO15360 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCAO15360 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCAO15360 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCAO15360 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCAO15360 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCAO15360 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCAO15360 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCAO15360 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCAO15360 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCAO15360 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCAO15360 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCAO15360 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCAO15360 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCAO15360 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCAO15360 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCAO15360 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCAO15360 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCAO15360 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCAO15360 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCAO15360 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCAO15360 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCAO15360 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCAO15360 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCAO15360 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCAO15360 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCAO15360 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCAO15360 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCAO15360 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCAO15360 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCAO15360 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCAO15360 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCAO15360 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCAO15360 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCAO15360 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCAO15360 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCAO15360 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCAO15360 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCAO15360 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCAO15360 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCAO15360 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCAO15360 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCAO15360 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCAO15360 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCAO15360 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCAO15360 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCAO15360 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCAO15360 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCAO15360 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCAO15360 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCAO15360 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCAO15360 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCAO15360 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCAO15360 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCAO15360 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCAO15360 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCAO15360 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCAO15360 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCAO15360 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCAO15360 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCAO15360 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCAO15360 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCAO15360 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCAO15360 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCAO15360 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCAO15360 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCAO15360 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCAO15360 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCAO15360 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCAO15360 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCAO15360 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCAO15360 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCAO15360 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCAO15360 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCAO15360 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCAO15360 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCAO15360 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms