Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms