Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms