Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms