Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

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Length 3,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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