Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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ARL2-SNX15V9GYD0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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ARL2-SNX15V9GYD0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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