Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X3

SNX5, Sorting nexin-5, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX5Q9Y5X3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms