Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKP3Q9Y446 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKP3Q9Y446 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKP3Q9Y446 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKP3Q9Y446 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKP3Q9Y446 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PKP3Q9Y446 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PKP3Q9Y446 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PKP3Q9Y446 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKP3Q9Y446 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms