Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KCNIP3Q9Y2W7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms