Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y294

ASF1A, Histone chaperone ASF1A, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1AQ9Y294 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASF1AQ9Y294 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASF1AQ9Y294 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASF1AQ9Y294 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ASF1AQ9Y294 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASF1AQ9Y294 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASF1AQ9Y294 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASF1AQ9Y294 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASF1AQ9Y294 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASF1AQ9Y294 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASF1AQ9Y294 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASF1AQ9Y294 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASF1AQ9Y294 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASF1AQ9Y294 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASF1AQ9Y294 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASF1AQ9Y294 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASF1AQ9Y294 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASF1AQ9Y294 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASF1AQ9Y294 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASF1AQ9Y294 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASF1AQ9Y294 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASF1AQ9Y294 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASF1AQ9Y294 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASF1AQ9Y294 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASF1AQ9Y294 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASF1AQ9Y294 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASF1AQ9Y294 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ASF1AQ9Y294 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ASF1AQ9Y294 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ASF1AQ9Y294 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ASF1AQ9Y294 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ASF1AQ9Y294 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ASF1AQ9Y294 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASF1AQ9Y294 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms