Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQC9

CLCA2, Calcium-activated chloride channel regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA2Q9UQC9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLCA2Q9UQC9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLCA2Q9UQC9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLCA2Q9UQC9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLCA2Q9UQC9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLCA2Q9UQC9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLCA2Q9UQC9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLCA2Q9UQC9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCA2Q9UQC9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCA2Q9UQC9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCA2Q9UQC9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCA2Q9UQC9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCA2Q9UQC9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCA2Q9UQC9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCA2Q9UQC9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCA2Q9UQC9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCA2Q9UQC9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCA2Q9UQC9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCA2Q9UQC9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCA2Q9UQC9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCA2Q9UQC9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCA2Q9UQC9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCA2Q9UQC9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCA2Q9UQC9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCA2Q9UQC9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCA2Q9UQC9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCA2Q9UQC9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCA2Q9UQC9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCA2Q9UQC9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCA2Q9UQC9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCA2Q9UQC9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCA2Q9UQC9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCA2Q9UQC9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCA2Q9UQC9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLCA2Q9UQC9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLCA2Q9UQC9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLCA2Q9UQC9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLCA2Q9UQC9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLCA2Q9UQC9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLCA2Q9UQC9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CLCA2Q9UQC9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLCA2Q9UQC9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms