Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TRAK1Q9UPV9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TRAK1Q9UPV9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TRAK1Q9UPV9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
TRAK1Q9UPV9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TRAK1Q9UPV9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TRAK1Q9UPV9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TRAK1Q9UPV9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TRAK1Q9UPV9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TRAK1Q9UPV9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TRAK1Q9UPV9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TRAK1Q9UPV9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TRAK1Q9UPV9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TRAK1Q9UPV9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TRAK1Q9UPV9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TRAK1Q9UPV9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TRAK1Q9UPV9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TRAK1Q9UPV9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TRAK1Q9UPV9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TRAK1Q9UPV9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TRAK1Q9UPV9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TRAK1Q9UPV9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
TRAK1Q9UPV9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TRAK1Q9UPV9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TRAK1Q9UPV9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TRAK1Q9UPV9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TRAK1Q9UPV9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TRAK1Q9UPV9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TRAK1Q9UPV9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TRAK1Q9UPV9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
TRAK1Q9UPV9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TRAK1Q9UPV9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TRAK1Q9UPV9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TRAK1Q9UPV9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TRAK1Q9UPV9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
TRAK1Q9UPV9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TRAK1Q9UPV9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TRAK1Q9UPV9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
TRAK1Q9UPV9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TRAK1Q9UPV9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TRAK1Q9UPV9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TRAK1Q9UPV9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
TRAK1Q9UPV9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TRAK1Q9UPV9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TRAK1Q9UPV9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TRAK1Q9UPV9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TRAK1Q9UPV9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TRAK1Q9UPV9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TRAK1Q9UPV9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TRAK1Q9UPV9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TRAK1Q9UPV9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TRAK1Q9UPV9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TRAK1Q9UPV9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TRAK1Q9UPV9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TRAK1Q9UPV9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
TRAK1Q9UPV9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TRAK1Q9UPV9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TRAK1Q9UPV9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TRAK1Q9UPV9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TRAK1Q9UPV9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
TRAK1Q9UPV9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
TRAK1Q9UPV9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TRAK1Q9UPV9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TRAK1Q9UPV9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TRAK1Q9UPV9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TRAK1Q9UPV9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TRAK1Q9UPV9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
TRAK1Q9UPV9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
TRAK1Q9UPV9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
TRAK1Q9UPV9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
TRAK1Q9UPV9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
TRAK1Q9UPV9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
TRAK1Q9UPV9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
TRAK1Q9UPV9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
TRAK1Q9UPV9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
TRAK1Q9UPV9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TRAK1Q9UPV9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TRAK1Q9UPV9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
TRAK1Q9UPV9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TRAK1Q9UPV9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TRAK1Q9UPV9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TRAK1Q9UPV9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TRAK1Q9UPV9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TRAK1Q9UPV9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TRAK1Q9UPV9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TRAK1Q9UPV9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TRAK1Q9UPV9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TRAK1Q9UPV9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TRAK1Q9UPV9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TRAK1Q9UPV9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TRAK1Q9UPV9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TRAK1Q9UPV9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TRAK1Q9UPV9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TRAK1Q9UPV9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TRAK1Q9UPV9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TRAK1Q9UPV9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TRAK1Q9UPV9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TRAK1Q9UPV9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TRAK1Q9UPV9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRAK1Q9UPV9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms