Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
L1RE1Q9UN81 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
L1RE1Q9UN81 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
L1RE1Q9UN81 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
L1RE1Q9UN81 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
L1RE1Q9UN81 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
L1RE1Q9UN81 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
L1RE1Q9UN81 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
L1RE1Q9UN81 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
L1RE1Q9UN81 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
L1RE1Q9UN81 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
L1RE1Q9UN81 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
L1RE1Q9UN81 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
L1RE1Q9UN81 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
L1RE1Q9UN81 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
L1RE1Q9UN81 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
L1RE1Q9UN81 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
L1RE1Q9UN81 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
L1RE1Q9UN81 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
L1RE1Q9UN81 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
L1RE1Q9UN81 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
L1RE1Q9UN81 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
L1RE1Q9UN81 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
L1RE1Q9UN81 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
L1RE1Q9UN81 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
L1RE1Q9UN81 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
L1RE1Q9UN81 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
L1RE1Q9UN81 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
L1RE1Q9UN81 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
L1RE1Q9UN81 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
L1RE1Q9UN81 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
L1RE1Q9UN81 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
L1RE1Q9UN81 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
L1RE1Q9UN81 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
L1RE1Q9UN81 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
L1RE1Q9UN81 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
L1RE1Q9UN81 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
L1RE1Q9UN81 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
L1RE1Q9UN81 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
L1RE1Q9UN81 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
L1RE1Q9UN81 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
L1RE1Q9UN81 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
L1RE1Q9UN81 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
L1RE1Q9UN81 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
L1RE1Q9UN81 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
L1RE1Q9UN81 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
L1RE1Q9UN81 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
L1RE1Q9UN81 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
L1RE1Q9UN81 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
L1RE1Q9UN81 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
L1RE1Q9UN81 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
L1RE1Q9UN81 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
L1RE1Q9UN81 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
L1RE1Q9UN81 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
L1RE1Q9UN81 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
L1RE1Q9UN81 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
L1RE1Q9UN81 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
L1RE1Q9UN81 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
L1RE1Q9UN81 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
L1RE1Q9UN81 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
L1RE1Q9UN81 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
L1RE1Q9UN81 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
L1RE1Q9UN81 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
L1RE1Q9UN81 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
L1RE1Q9UN81 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
L1RE1Q9UN81 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
L1RE1Q9UN81 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
L1RE1Q9UN81 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
L1RE1Q9UN81 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
L1RE1Q9UN81 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
L1RE1Q9UN81 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
L1RE1Q9UN81 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
L1RE1Q9UN81 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
L1RE1Q9UN81 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
L1RE1Q9UN81 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
L1RE1Q9UN81 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
L1RE1Q9UN81 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms