Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ6

CAPN11, Calpain-11, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN11Q9UMQ6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN11Q9UMQ6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms