Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZMYND8Q9ULU4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ZMYND8Q9ULU4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZMYND8Q9ULU4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZMYND8Q9ULU4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZMYND8Q9ULU4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZMYND8Q9ULU4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZMYND8Q9ULU4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZMYND8Q9ULU4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZMYND8Q9ULU4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZMYND8Q9ULU4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZMYND8Q9ULU4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZMYND8Q9ULU4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZMYND8Q9ULU4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZMYND8Q9ULU4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZMYND8Q9ULU4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZMYND8Q9ULU4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZMYND8Q9ULU4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZMYND8Q9ULU4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ZMYND8Q9ULU4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZMYND8Q9ULU4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZMYND8Q9ULU4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ZMYND8Q9ULU4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZMYND8Q9ULU4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZMYND8Q9ULU4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZMYND8Q9ULU4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZMYND8Q9ULU4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZMYND8Q9ULU4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZMYND8Q9ULU4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZMYND8Q9ULU4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZMYND8Q9ULU4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZMYND8Q9ULU4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZMYND8Q9ULU4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZMYND8Q9ULU4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZMYND8Q9ULU4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZMYND8Q9ULU4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ZMYND8Q9ULU4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZMYND8Q9ULU4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZMYND8Q9ULU4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZMYND8Q9ULU4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZMYND8Q9ULU4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZMYND8Q9ULU4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZMYND8Q9ULU4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZMYND8Q9ULU4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ZMYND8Q9ULU4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZMYND8Q9ULU4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZMYND8Q9ULU4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZMYND8Q9ULU4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms