Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM2

ZNF490, Zinc finger protein 490, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF490Q9ULM2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF490Q9ULM2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms