Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PADI1Q9ULC6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms