Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL19

RARRES3, Retinoic acid receptor responder protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES3Q9UL19 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RARRES3Q9UL19 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RARRES3Q9UL19 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RARRES3Q9UL19 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARRES3Q9UL19 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARRES3Q9UL19 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARRES3Q9UL19 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RARRES3Q9UL19 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARRES3Q9UL19 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARRES3Q9UL19 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARRES3Q9UL19 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARRES3Q9UL19 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RARRES3Q9UL19 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARRES3Q9UL19 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARRES3Q9UL19 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARRES3Q9UL19 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARRES3Q9UL19 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARRES3Q9UL19 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARRES3Q9UL19 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARRES3Q9UL19 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARRES3Q9UL19 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARRES3Q9UL19 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RARRES3Q9UL19 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RARRES3Q9UL19 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARRES3Q9UL19 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARRES3Q9UL19 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARRES3Q9UL19 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARRES3Q9UL19 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARRES3Q9UL19 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARRES3Q9UL19 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARRES3Q9UL19 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RARRES3Q9UL19 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RARRES3Q9UL19 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RARRES3Q9UL19 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RARRES3Q9UL19 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RARRES3Q9UL19 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RARRES3Q9UL19 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RARRES3Q9UL19 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RARRES3Q9UL19 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RARRES3Q9UL19 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RARRES3Q9UL19 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RARRES3Q9UL19 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RARRES3Q9UL19 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RARRES3Q9UL19 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms