Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ9

PCOLCE2, Procollagen C-endopeptidase enhancer 2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCE2Q9UKZ9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PCOLCE2Q9UKZ9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PCOLCE2Q9UKZ9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PCOLCE2Q9UKZ9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCOLCE2Q9UKZ9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCOLCE2Q9UKZ9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCOLCE2Q9UKZ9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCOLCE2Q9UKZ9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCOLCE2Q9UKZ9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCOLCE2Q9UKZ9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCOLCE2Q9UKZ9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCOLCE2Q9UKZ9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCOLCE2Q9UKZ9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCOLCE2Q9UKZ9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCOLCE2Q9UKZ9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCOLCE2Q9UKZ9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCOLCE2Q9UKZ9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCOLCE2Q9UKZ9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCOLCE2Q9UKZ9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PCOLCE2Q9UKZ9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCOLCE2Q9UKZ9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCOLCE2Q9UKZ9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCOLCE2Q9UKZ9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCOLCE2Q9UKZ9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCOLCE2Q9UKZ9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCOLCE2Q9UKZ9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCOLCE2Q9UKZ9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCOLCE2Q9UKZ9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCOLCE2Q9UKZ9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PCOLCE2Q9UKZ9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCOLCE2Q9UKZ9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCOLCE2Q9UKZ9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCOLCE2Q9UKZ9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCOLCE2Q9UKZ9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCOLCE2Q9UKZ9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PCOLCE2Q9UKZ9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCOLCE2Q9UKZ9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCOLCE2Q9UKZ9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCOLCE2Q9UKZ9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCOLCE2Q9UKZ9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCOLCE2Q9UKZ9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCOLCE2Q9UKZ9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCOLCE2Q9UKZ9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCOLCE2Q9UKZ9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCOLCE2Q9UKZ9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCOLCE2Q9UKZ9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCOLCE2Q9UKZ9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCOLCE2Q9UKZ9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCOLCE2Q9UKZ9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCOLCE2Q9UKZ9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCOLCE2Q9UKZ9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCOLCE2Q9UKZ9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCOLCE2Q9UKZ9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCOLCE2Q9UKZ9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCOLCE2Q9UKZ9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCOLCE2Q9UKZ9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCOLCE2Q9UKZ9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCOLCE2Q9UKZ9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCOLCE2Q9UKZ9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCOLCE2Q9UKZ9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCOLCE2Q9UKZ9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCOLCE2Q9UKZ9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCOLCE2Q9UKZ9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCOLCE2Q9UKZ9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCOLCE2Q9UKZ9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCOLCE2Q9UKZ9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCOLCE2Q9UKZ9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCOLCE2Q9UKZ9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCOLCE2Q9UKZ9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCOLCE2Q9UKZ9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCOLCE2Q9UKZ9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCOLCE2Q9UKZ9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCOLCE2Q9UKZ9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCOLCE2Q9UKZ9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCOLCE2Q9UKZ9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCOLCE2Q9UKZ9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCOLCE2Q9UKZ9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCOLCE2Q9UKZ9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCOLCE2Q9UKZ9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCOLCE2Q9UKZ9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCOLCE2Q9UKZ9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCOLCE2Q9UKZ9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCOLCE2Q9UKZ9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCOLCE2Q9UKZ9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCOLCE2Q9UKZ9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCOLCE2Q9UKZ9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCOLCE2Q9UKZ9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCOLCE2Q9UKZ9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCOLCE2Q9UKZ9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCOLCE2Q9UKZ9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCOLCE2Q9UKZ9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCOLCE2Q9UKZ9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCOLCE2Q9UKZ9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PCOLCE2Q9UKZ9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCOLCE2Q9UKZ9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCOLCE2Q9UKZ9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCOLCE2Q9UKZ9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCOLCE2Q9UKZ9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCOLCE2Q9UKZ9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCOLCE2Q9UKZ9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms