Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKQ2

ADAM28, Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADAM28Q9UKQ2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ADAM28Q9UKQ2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ADAM28Q9UKQ2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ADAM28Q9UKQ2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ADAM28Q9UKQ2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ADAM28Q9UKQ2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ADAM28Q9UKQ2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ADAM28Q9UKQ2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ADAM28Q9UKQ2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ADAM28Q9UKQ2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ADAM28Q9UKQ2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ADAM28Q9UKQ2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ADAM28Q9UKQ2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ADAM28Q9UKQ2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ADAM28Q9UKQ2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ADAM28Q9UKQ2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ADAM28Q9UKQ2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ADAM28Q9UKQ2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ADAM28Q9UKQ2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ADAM28Q9UKQ2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ADAM28Q9UKQ2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ADAM28Q9UKQ2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ADAM28Q9UKQ2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ADAM28Q9UKQ2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ADAM28Q9UKQ2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ADAM28Q9UKQ2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ADAM28Q9UKQ2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ADAM28Q9UKQ2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ADAM28Q9UKQ2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ADAM28Q9UKQ2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ADAM28Q9UKQ2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ADAM28Q9UKQ2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ADAM28Q9UKQ2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ADAM28Q9UKQ2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ADAM28Q9UKQ2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ADAM28Q9UKQ2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ADAM28Q9UKQ2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ADAM28Q9UKQ2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ADAM28Q9UKQ2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ADAM28Q9UKQ2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ADAM28Q9UKQ2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ADAM28Q9UKQ2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ADAM28Q9UKQ2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ADAM28Q9UKQ2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ADAM28Q9UKQ2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ADAM28Q9UKQ2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ADAM28Q9UKQ2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ADAM28Q9UKQ2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ADAM28Q9UKQ2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ADAM28Q9UKQ2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ADAM28Q9UKQ2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ADAM28Q9UKQ2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ADAM28Q9UKQ2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ADAM28Q9UKQ2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ADAM28Q9UKQ2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ADAM28Q9UKQ2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ADAM28Q9UKQ2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ADAM28Q9UKQ2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ADAM28Q9UKQ2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ADAM28Q9UKQ2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ADAM28Q9UKQ2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ADAM28Q9UKQ2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ADAM28Q9UKQ2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ADAM28Q9UKQ2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ADAM28Q9UKQ2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ADAM28Q9UKQ2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ADAM28Q9UKQ2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ADAM28Q9UKQ2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ADAM28Q9UKQ2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ADAM28Q9UKQ2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ADAM28Q9UKQ2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ADAM28Q9UKQ2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ADAM28Q9UKQ2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ADAM28Q9UKQ2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ADAM28Q9UKQ2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ADAM28Q9UKQ2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ADAM28Q9UKQ2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ADAM28Q9UKQ2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ADAM28Q9UKQ2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ADAM28Q9UKQ2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ADAM28Q9UKQ2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ADAM28Q9UKQ2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ADAM28Q9UKQ2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ADAM28Q9UKQ2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ADAM28Q9UKQ2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ADAM28Q9UKQ2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ADAM28Q9UKQ2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ADAM28Q9UKQ2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ADAM28Q9UKQ2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ADAM28Q9UKQ2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ADAM28Q9UKQ2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ADAM28Q9UKQ2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ADAM28Q9UKQ2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms