Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG4

SLC13A4, Solute carrier family 13 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A4Q9UKG4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC13A4Q9UKG4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms