Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRTO4Q9UKD2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms