Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH22Q9UJ99 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH22Q9UJ99 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH22Q9UJ99 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH22Q9UJ99 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH22Q9UJ99 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH22Q9UJ99 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH22Q9UJ99 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH22Q9UJ99 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH22Q9UJ99 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH22Q9UJ99 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH22Q9UJ99 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH22Q9UJ99 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH22Q9UJ99 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH22Q9UJ99 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH22Q9UJ99 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH22Q9UJ99 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH22Q9UJ99 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH22Q9UJ99 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH22Q9UJ99 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH22Q9UJ99 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH22Q9UJ99 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH22Q9UJ99 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH22Q9UJ99 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH22Q9UJ99 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH22Q9UJ99 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH22Q9UJ99 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH22Q9UJ99 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH22Q9UJ99 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH22Q9UJ99 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH22Q9UJ99 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH22Q9UJ99 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH22Q9UJ99 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH22Q9UJ99 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH22Q9UJ99 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH22Q9UJ99 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH22Q9UJ99 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH22Q9UJ99 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH22Q9UJ99 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH22Q9UJ99 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH22Q9UJ99 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH22Q9UJ99 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH22Q9UJ99 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH22Q9UJ99 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH22Q9UJ99 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH22Q9UJ99 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH22Q9UJ99 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH22Q9UJ99 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH22Q9UJ99 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH22Q9UJ99 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH22Q9UJ99 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH22Q9UJ99 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH22Q9UJ99 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH22Q9UJ99 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH22Q9UJ99 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH22Q9UJ99 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH22Q9UJ99 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH22Q9UJ99 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH22Q9UJ99 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH22Q9UJ99 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH22Q9UJ99 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH22Q9UJ99 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH22Q9UJ99 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH22Q9UJ99 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH22Q9UJ99 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH22Q9UJ99 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH22Q9UJ99 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH22Q9UJ99 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH22Q9UJ99 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH22Q9UJ99 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH22Q9UJ99 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH22Q9UJ99 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH22Q9UJ99 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH22Q9UJ99 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH22Q9UJ99 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH22Q9UJ99 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH22Q9UJ99 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH22Q9UJ99 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH22Q9UJ99 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH22Q9UJ99 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH22Q9UJ99 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH22Q9UJ99 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH22Q9UJ99 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH22Q9UJ99 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH22Q9UJ99 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms