Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTNNA3Q9UI47 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CTNNA3Q9UI47 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTNNA3Q9UI47 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTNNA3Q9UI47 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CTNNA3Q9UI47 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CTNNA3Q9UI47 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTNNA3Q9UI47 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTNNA3Q9UI47 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTNNA3Q9UI47 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTNNA3Q9UI47 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTNNA3Q9UI47 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTNNA3Q9UI47 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTNNA3Q9UI47 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTNNA3Q9UI47 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTNNA3Q9UI47 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CTNNA3Q9UI47 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTNNA3Q9UI47 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTNNA3Q9UI47 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTNNA3Q9UI47 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTNNA3Q9UI47 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTNNA3Q9UI47 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTNNA3Q9UI47 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CTNNA3Q9UI47 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTNNA3Q9UI47 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTNNA3Q9UI47 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTNNA3Q9UI47 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTNNA3Q9UI47 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTNNA3Q9UI47 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTNNA3Q9UI47 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTNNA3Q9UI47 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTNNA3Q9UI47 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTNNA3Q9UI47 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTNNA3Q9UI47 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTNNA3Q9UI47 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTNNA3Q9UI47 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTNNA3Q9UI47 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTNNA3Q9UI47 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTNNA3Q9UI47 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTNNA3Q9UI47 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTNNA3Q9UI47 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTNNA3Q9UI47 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTNNA3Q9UI47 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTNNA3Q9UI47 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTNNA3Q9UI47 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTNNA3Q9UI47 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTNNA3Q9UI47 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms