Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PUF60Q9UHX1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PUF60Q9UHX1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PUF60Q9UHX1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms