Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA9Q9UGM1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA9Q9UGM1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA9Q9UGM1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA9Q9UGM1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA9Q9UGM1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA9Q9UGM1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA9Q9UGM1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA9Q9UGM1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA9Q9UGM1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA9Q9UGM1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA9Q9UGM1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA9Q9UGM1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA9Q9UGM1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA9Q9UGM1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA9Q9UGM1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA9Q9UGM1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA9Q9UGM1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA9Q9UGM1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA9Q9UGM1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNA9Q9UGM1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNA9Q9UGM1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNA9Q9UGM1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNA9Q9UGM1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNA9Q9UGM1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNA9Q9UGM1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNA9Q9UGM1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNA9Q9UGM1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNA9Q9UGM1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNA9Q9UGM1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNA9Q9UGM1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNA9Q9UGM1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA9Q9UGM1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA9Q9UGM1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA9Q9UGM1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA9Q9UGM1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA9Q9UGM1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA9Q9UGM1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA9Q9UGM1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA9Q9UGM1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNA9Q9UGM1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNA9Q9UGM1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNA9Q9UGM1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNA9Q9UGM1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNA9Q9UGM1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms