Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNAL1Q9UBT7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNAL1Q9UBT7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNAL1Q9UBT7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNAL1Q9UBT7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNAL1Q9UBT7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNNAL1Q9UBT7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNNAL1Q9UBT7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNNAL1Q9UBT7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNNAL1Q9UBT7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNNAL1Q9UBT7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNNAL1Q9UBT7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNNAL1Q9UBT7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTNNAL1Q9UBT7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTNNAL1Q9UBT7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTNNAL1Q9UBT7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNAL1Q9UBT7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNAL1Q9UBT7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNAL1Q9UBT7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNAL1Q9UBT7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNAL1Q9UBT7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNAL1Q9UBT7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNAL1Q9UBT7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNAL1Q9UBT7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNAL1Q9UBT7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNAL1Q9UBT7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNAL1Q9UBT7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNAL1Q9UBT7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNAL1Q9UBT7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNNAL1Q9UBT7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNNAL1Q9UBT7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNNAL1Q9UBT7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNNAL1Q9UBT7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNNAL1Q9UBT7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNNAL1Q9UBT7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNNAL1Q9UBT7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNNAL1Q9UBT7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNNAL1Q9UBT7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNNAL1Q9UBT7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNAL1Q9UBT7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNAL1Q9UBT7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNAL1Q9UBT7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNAL1Q9UBT7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNAL1Q9UBT7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNAL1Q9UBT7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNAL1Q9UBT7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNAL1Q9UBT7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNAL1Q9UBT7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNAL1Q9UBT7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNAL1Q9UBT7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNAL1Q9UBT7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNAL1Q9UBT7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNAL1Q9UBT7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNAL1Q9UBT7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNAL1Q9UBT7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNAL1Q9UBT7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTNNAL1Q9UBT7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTNNAL1Q9UBT7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 274.7 ms