Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS29Q9UBQ0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS29Q9UBQ0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS29Q9UBQ0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS29Q9UBQ0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS29Q9UBQ0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS29Q9UBQ0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS29Q9UBQ0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS29Q9UBQ0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS29Q9UBQ0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS29Q9UBQ0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS29Q9UBQ0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS29Q9UBQ0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS29Q9UBQ0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS29Q9UBQ0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS29Q9UBQ0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS29Q9UBQ0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS29Q9UBQ0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS29Q9UBQ0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS29Q9UBQ0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS29Q9UBQ0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS29Q9UBQ0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS29Q9UBQ0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS29Q9UBQ0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS29Q9UBQ0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS29Q9UBQ0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS29Q9UBQ0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS29Q9UBQ0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS29Q9UBQ0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS29Q9UBQ0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS29Q9UBQ0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS29Q9UBQ0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS29Q9UBQ0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS29Q9UBQ0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS29Q9UBQ0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS29Q9UBQ0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS29Q9UBQ0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS29Q9UBQ0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS29Q9UBQ0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS29Q9UBQ0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS29Q9UBQ0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS29Q9UBQ0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS29Q9UBQ0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS29Q9UBQ0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS29Q9UBQ0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS29Q9UBQ0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS29Q9UBQ0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS29Q9UBQ0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS29Q9UBQ0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS29Q9UBQ0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS29Q9UBQ0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 287.1 ms