Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms