Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2I0

CPSF2, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF2Q9P2I0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPSF2Q9P2I0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CPSF2Q9P2I0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPSF2Q9P2I0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPSF2Q9P2I0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPSF2Q9P2I0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPSF2Q9P2I0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPSF2Q9P2I0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms