Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCHIP1Q9P0W5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms