Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.371e-6■■■■□ 24.3
AATFQ9NY61 MICALL2-203ENST00000460198 533 ntTSL 322.62■■□□□ 1.211e-6■■■■□ 24.3
AATFQ9NY61 SLC6A6-203ENST00000610642 1983 ntTSL 222.56■■□□□ 1.21e-6■■■■□ 24.3
AATFQ9NY61 TMEM131L-204ENST00000445960 538 ntTSL 421.49■■□□□ 1.031e-6■■■■□ 24.3
AATFQ9NY61 SLC6A6-209ENST00000622176 1116 ntTSL 1 (best)21.09■□□□□ 0.971e-6■■■■□ 24.3
AATFQ9NY61 SLC6A6-211ENST00000622810 565 ntTSL 420.85■□□□□ 0.931e-6■■■■□ 24.3
AATFQ9NY61 SLC6A6-206ENST00000615188 689 ntTSL 320.34■□□□□ 0.851e-6■■■■□ 24.3
AATFQ9NY61 ACAP3-206ENST00000467278 2725 ntTSL 1 (best)19.57■□□□□ 0.721e-6■■■■□ 24.3
AATFQ9NY61 GNA11-203ENST00000586763 354 ntTSL 319.35■□□□□ 0.691e-6■■■■□ 24.3
AATFQ9NY61 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.451e-6■■■■□ 24.3
AATFQ9NY61 ARFRP1-204ENST00000609537 593 ntTSL 317.39■□□□□ 0.371e-6■■■■□ 24.3
AATFQ9NY61 DGAT1-203ENST00000524965 1336 ntTSL 516.32■□□□□ 0.21e-6■■■■□ 24.3
AATFQ9NY61 ARFRP1-206ENST00000610774 5178 ntTSL 216.08■□□□□ 0.161e-6■■■■□ 24.3
AATFQ9NY61 EEF1D-214ENST00000526135 535 ntTSL 215.73■□□□□ 0.111e-6■■■■□ 24.3
AATFQ9NY61 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.071e-6■■■■□ 24.3
AATFQ9NY61 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.061e-6■■■■□ 24.3
AATFQ9NY61 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.011e-6■■■■□ 24.3
AATFQ9NY61 SLC6A6-210ENST00000622186 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.271e-6■■■■□ 24.3
AATFQ9NY61 SLC6A6-204ENST00000613060 6526 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.291e-6■■■■□ 24.3
AATFQ9NY61 SLC6A6-207ENST00000618278 6401 ntTSL 512.35□□□□□ -0.431e-6■■■■□ 24.3
AATFQ9NY61 DGAT1-202ENST00000524844 401 ntTSL 39.15□□□□□ -0.941e-6■■■■□ 24.3
AATFQ9NY61 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.091e-6■■■■□ 24.3
AATFQ9NY61 ARFRP1-201ENST00000424545 384 ntTSL 28.2□□□□□ -1.11e-6■■■■□ 24.3
AATFQ9NY61 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.71e-6■■■■□ 24.3
AATFQ9NY61 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.21□□□□□ -2.221e-6■■■■□ 24.3
AATFQ9NY61 ACVR1-206ENST00000424669 550 ntTSL 416.65■□□□□ 0.267e-9■■■■□ 24.3
AATFQ9NY61 ACVR1-207ENST00000434821 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.27e-9■■■■□ 24.3
AATFQ9NY61 ACVR1-210ENST00000539637 564 ntTSL 413.44□□□□□ -0.267e-9■■■■□ 24.3
AATFQ9NY61 ACVR1-205ENST00000413751 536 ntTSL 47.33□□□□□ -1.247e-9■■■■□ 24.3
AATFQ9NY61 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.689e-7■■■■□ 24.2
AATFQ9NY61 AC006001.2-202ENST00000439360 508 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.029e-7■■■■□ 24.2
AATFQ9NY61 RABGEF1-211ENST00000503687 4139 ntTSL 214.61□□□□□ -0.079e-7■■■■□ 24.2
AATFQ9NY61 AC006001.2-203ENST00000428557 304 ntTSL 314.47□□□□□ -0.099e-7■■■■□ 24.2
AATFQ9NY61 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.94□□□□□ -2.11e-323■■■■□ 24.1
AATFQ9NY61 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.232e-6■■■■□ 24.1
AATFQ9NY61 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.27□□□□□ -2.371e-323■■■■□ 24.1
AATFQ9NY61 NPRL3-213ENST00000621703 2812 ntTSL 1 (best)19.09■□□□□ 0.652e-9■■■■□ 24
AATFQ9NY61 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.592e-9■■■■□ 24
AATFQ9NY61 NPRL3-214ENST00000622194 2981 ntTSL 518.58■□□□□ 0.562e-9■■■■□ 24
AATFQ9NY61 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.522e-9■■■■□ 24
AATFQ9NY61 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.292e-9■■■■□ 24
AATFQ9NY61 NPRL3-208ENST00000473674 855 ntTSL 312.93□□□□□ -0.342e-9■■■■□ 24
AATFQ9NY61 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC6.63□□□□□ -1.352e-9■■■■□ 23.9
AATFQ9NY61 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.112e-6■■■■□ 23.9
AATFQ9NY61 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.672e-6■■■■□ 23.9
AATFQ9NY61 ARFRP1-211ENST00000618568 1612 ntTSL 324.75■■□□□ 1.552e-6■■■■□ 23.9
AATFQ9NY61 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.142e-6■■■■□ 23.9
AATFQ9NY61 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.872e-6■■■■□ 23.9
AATFQ9NY61 TMEM241-211ENST00000578520 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 328.17■■■□□ 2.11e-6■■■■□ 23.9
AATFQ9NY61 TMEM241-202ENST00000460322 889 ntTSL 526.23■■□□□ 1.791e-6■■■■□ 23.9
AATFQ9NY61 TMEM241-206ENST00000482411 667 ntTSL 525.17■■□□□ 1.621e-6■■■■□ 23.9
AATFQ9NY61 TMEM241-214ENST00000581444 1404 ntTSL 224.1■■□□□ 1.451e-6■■■■□ 23.9
AATFQ9NY61 TMEM241-207ENST00000497608 669 ntTSL 323.53■■□□□ 1.361e-6■■■■□ 23.9
AATFQ9NY61 TMEM241-213ENST00000580025 571 ntTSL 423.53■■□□□ 1.361e-6■■■■□ 23.9
AATFQ9NY61 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.991e-6■■■■□ 23.9
AATFQ9NY61 TMEM241-215ENST00000582336 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 320.58■□□□□ 0.891e-6■■■■□ 23.9
AATFQ9NY61 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.861e-6■■■■□ 23.9
AATFQ9NY61 TMEM241-205ENST00000477053 2859 ntTSL 219.93■□□□□ 0.781e-6■■■■□ 23.9
AATFQ9NY61 TMEM241-203ENST00000473688 2941 ntTSL 1 (best)19.11■□□□□ 0.651e-6■■■■□ 23.9
AATFQ9NY61 TMEM241-208ENST00000542162 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.111e-6■■■■□ 23.9
AATFQ9NY61 TMEM241-201ENST00000383233 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.591e-6■■■■□ 23.9
AATFQ9NY61 TMEM241-210ENST00000577531 590 ntTSL 47.13□□□□□ -1.271e-6■■■■□ 23.9
AATFQ9NY61 MICALL2-212ENST00000487187 764 ntTSL 522.13■■□□□ 1.133e-7■■■■□ 23.9
AATFQ9NY61 DDB2-212ENST00000617022 2181 ntTSL 218.94■□□□□ 0.623e-10■■■■□ 23.7
AATFQ9NY61 DDB2-203ENST00000378601 1591 ntTSL 217.36■□□□□ 0.373e-10■■■■□ 23.7
AATFQ9NY61 DDB2-213ENST00000617847 1649 ntTSL 515.14■□□□□ 0.013e-10■■■■□ 23.7
AATFQ9NY61 DDB2-201ENST00000256996 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.083e-10■■■■□ 23.7
AATFQ9NY61 DDB2-202ENST00000378600 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.213e-10■■■■□ 23.7
AATFQ9NY61 DDB2-204ENST00000378603 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.213e-10■■■■□ 23.7
AATFQ9NY61 DDB2-211ENST00000616278 960 ntTSL 213.75□□□□□ -0.213e-10■■■■□ 23.7
AATFQ9NY61 DDB2-206ENST00000612309 3101 ntTSL 29.35□□□□□ -0.913e-10■■■■□ 23.7
AATFQ9NY61 DDB2-214ENST00000620515 347 ntTSL 39.24□□□□□ -0.933e-10■■■■□ 23.7
AATFQ9NY61 SEPT2-244ENST00000495463 501 ntTSL 434.27■■■■□ 3.083e-6■■■■□ 23.5
AATFQ9NY61 SEPT2-234ENST00000475474 749 ntTSL 231.67■■■□□ 2.663e-6■■■■□ 23.5
AATFQ9NY61 SEPT2-238ENST00000482304 740 ntTSL 230.56■■■□□ 2.483e-6■■■■□ 23.5
AATFQ9NY61 SEPT2-216ENST00000434955 480 ntTSL 328.27■■■□□ 2.123e-6■■■■□ 23.5
AATFQ9NY61 UBALD1-207ENST00000591113 659 ntTSL 527.44■■□□□ 1.983e-6■■■■□ 23.5
AATFQ9NY61 SEPT2-217ENST00000436795 775 ntTSL 527.23■■□□□ 1.953e-6■■■■□ 23.5
AATFQ9NY61 SEPT2-209ENST00000411484 561 ntTSL 427.17■■□□□ 1.943e-6■■■■□ 23.5
AATFQ9NY61 SEPT2-226ENST00000461048 1163 ntTSL 1 (best)26.6■■□□□ 1.853e-6■■■■□ 23.5
AATFQ9NY61 SEPT2-215ENST00000429791 724 ntTSL 426■■□□□ 1.753e-6■■■■□ 23.5
AATFQ9NY61 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.183e-6■■■■□ 23.5
AATFQ9NY61 AP2A2-212ENST00000528195 562 ntTSL 322.15■■□□□ 1.143e-6■■■■□ 23.5
AATFQ9NY61 SCART1-205ENST00000488261 4709 ntTSL 222.14■■□□□ 1.133e-6■■■■□ 23.5
AATFQ9NY61 CDC42EP1-203ENST00000430687 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 321.85■■□□□ 1.093e-6■■■■□ 23.5
AATFQ9NY61 SCART1-202ENST00000463137 4756 ntTSL 221.78■■□□□ 1.083e-6■■■■□ 23.5
AATFQ9NY61 SCART1-204ENST00000482993 4904 ntTSL 221.61■■□□□ 1.053e-6■■■■□ 23.5
AATFQ9NY61 SEPT2-218ENST00000437066 574 ntTSL 421.51■■□□□ 1.033e-6■■■■□ 23.5
AATFQ9NY61 AKT1-204ENST00000544168 1564 ntTSL 220.44■□□□□ 0.863e-6■■■■□ 23.5
AATFQ9NY61 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.783e-6■■■■□ 23.5
AATFQ9NY61 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.583e-6■■■■□ 23.5
AATFQ9NY61 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.553e-6■■■■□ 23.5
AATFQ9NY61 AKT1-218ENST00000557552 8396 ntTSL 518.2■□□□□ 0.53e-6■■■■□ 23.5
AATFQ9NY61 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.363e-6■■■■□ 23.5
AATFQ9NY61 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.213e-6■■■■□ 23.5
AATFQ9NY61 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.23e-6■■■■□ 23.5
AATFQ9NY61 AP2A2-213ENST00000528815 3072 ntTSL 215.52■□□□□ 0.083e-6■■■■□ 23.5
AATFQ9NY61 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.073e-6■■■■□ 23.5
AATFQ9NY61 SEPT2-240ENST00000484648 218 ntTSL 314.1□□□□□ -0.153e-6■■■■□ 23.5
AATFQ9NY61 SEPT2-224ENST00000457335 570 ntTSL 413.06□□□□□ -0.323e-6■■■■□ 23.5
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