Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALKBH4Q9NXW9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALKBH4Q9NXW9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALKBH4Q9NXW9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALKBH4Q9NXW9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ALKBH4Q9NXW9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALKBH4Q9NXW9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALKBH4Q9NXW9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALKBH4Q9NXW9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALKBH4Q9NXW9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALKBH4Q9NXW9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALKBH4Q9NXW9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALKBH4Q9NXW9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALKBH4Q9NXW9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALKBH4Q9NXW9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALKBH4Q9NXW9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALKBH4Q9NXW9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALKBH4Q9NXW9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALKBH4Q9NXW9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ALKBH4Q9NXW9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALKBH4Q9NXW9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALKBH4Q9NXW9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALKBH4Q9NXW9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALKBH4Q9NXW9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALKBH4Q9NXW9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALKBH4Q9NXW9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALKBH4Q9NXW9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALKBH4Q9NXW9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALKBH4Q9NXW9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALKBH4Q9NXW9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALKBH4Q9NXW9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALKBH4Q9NXW9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALKBH4Q9NXW9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALKBH4Q9NXW9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALKBH4Q9NXW9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALKBH4Q9NXW9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ALKBH4Q9NXW9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms