Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVN3

RIC8B, Synembryn-B, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIC8BQ9NVN3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIC8BQ9NVN3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIC8BQ9NVN3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIC8BQ9NVN3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIC8BQ9NVN3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIC8BQ9NVN3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIC8BQ9NVN3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIC8BQ9NVN3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIC8BQ9NVN3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIC8BQ9NVN3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RIC8BQ9NVN3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIC8BQ9NVN3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIC8BQ9NVN3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIC8BQ9NVN3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIC8BQ9NVN3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIC8BQ9NVN3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIC8BQ9NVN3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIC8BQ9NVN3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RIC8BQ9NVN3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIC8BQ9NVN3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RIC8BQ9NVN3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIC8BQ9NVN3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIC8BQ9NVN3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIC8BQ9NVN3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIC8BQ9NVN3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIC8BQ9NVN3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIC8BQ9NVN3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIC8BQ9NVN3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIC8BQ9NVN3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIC8BQ9NVN3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIC8BQ9NVN3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIC8BQ9NVN3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIC8BQ9NVN3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIC8BQ9NVN3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RIC8BQ9NVN3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIC8BQ9NVN3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIC8BQ9NVN3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms