Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV79

PCMTD2, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD2Q9NV79 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCMTD2Q9NV79 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCMTD2Q9NV79 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCMTD2Q9NV79 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PCMTD2Q9NV79 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCMTD2Q9NV79 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCMTD2Q9NV79 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCMTD2Q9NV79 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCMTD2Q9NV79 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCMTD2Q9NV79 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCMTD2Q9NV79 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCMTD2Q9NV79 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCMTD2Q9NV79 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCMTD2Q9NV79 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PCMTD2Q9NV79 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCMTD2Q9NV79 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCMTD2Q9NV79 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCMTD2Q9NV79 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCMTD2Q9NV79 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCMTD2Q9NV79 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCMTD2Q9NV79 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCMTD2Q9NV79 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCMTD2Q9NV79 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCMTD2Q9NV79 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCMTD2Q9NV79 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCMTD2Q9NV79 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCMTD2Q9NV79 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCMTD2Q9NV79 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCMTD2Q9NV79 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCMTD2Q9NV79 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCMTD2Q9NV79 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCMTD2Q9NV79 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCMTD2Q9NV79 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCMTD2Q9NV79 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PCMTD2Q9NV79 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCMTD2Q9NV79 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCMTD2Q9NV79 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCMTD2Q9NV79 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCMTD2Q9NV79 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCMTD2Q9NV79 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCMTD2Q9NV79 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCMTD2Q9NV79 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCMTD2Q9NV79 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCMTD2Q9NV79 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCMTD2Q9NV79 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCMTD2Q9NV79 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCMTD2Q9NV79 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCMTD2Q9NV79 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCMTD2Q9NV79 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCMTD2Q9NV79 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCMTD2Q9NV79 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCMTD2Q9NV79 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCMTD2Q9NV79 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCMTD2Q9NV79 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCMTD2Q9NV79 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCMTD2Q9NV79 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCMTD2Q9NV79 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCMTD2Q9NV79 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCMTD2Q9NV79 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCMTD2Q9NV79 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCMTD2Q9NV79 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCMTD2Q9NV79 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCMTD2Q9NV79 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCMTD2Q9NV79 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCMTD2Q9NV79 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCMTD2Q9NV79 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCMTD2Q9NV79 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCMTD2Q9NV79 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCMTD2Q9NV79 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCMTD2Q9NV79 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PCMTD2Q9NV79 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCMTD2Q9NV79 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms