Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS26

SPANXA1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome A, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXA1Q9NS26 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPANXA1Q9NS26 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPANXA1Q9NS26 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPANXA1Q9NS26 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPANXA1Q9NS26 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPANXA1Q9NS26 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPANXA1Q9NS26 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPANXA1Q9NS26 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPANXA1Q9NS26 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPANXA1Q9NS26 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPANXA1Q9NS26 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPANXA1Q9NS26 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPANXA1Q9NS26 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPANXA1Q9NS26 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPANXA1Q9NS26 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPANXA1Q9NS26 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPANXA1Q9NS26 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPANXA1Q9NS26 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPANXA1Q9NS26 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPANXA1Q9NS26 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPANXA1Q9NS26 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPANXA1Q9NS26 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPANXA1Q9NS26 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPANXA1Q9NS26 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SPANXA1Q9NS26 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SPANXA1Q9NS26 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPANXA1Q9NS26 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms