Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LTBP3Q9NS15 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LTBP3Q9NS15 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LTBP3Q9NS15 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LTBP3Q9NS15 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LTBP3Q9NS15 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LTBP3Q9NS15 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LTBP3Q9NS15 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LTBP3Q9NS15 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LTBP3Q9NS15 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LTBP3Q9NS15 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LTBP3Q9NS15 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
LTBP3Q9NS15 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LTBP3Q9NS15 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LTBP3Q9NS15 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
LTBP3Q9NS15 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LTBP3Q9NS15 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LTBP3Q9NS15 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
LTBP3Q9NS15 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LTBP3Q9NS15 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LTBP3Q9NS15 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LTBP3Q9NS15 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LTBP3Q9NS15 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LTBP3Q9NS15 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LTBP3Q9NS15 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LTBP3Q9NS15 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LTBP3Q9NS15 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LTBP3Q9NS15 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LTBP3Q9NS15 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LTBP3Q9NS15 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LTBP3Q9NS15 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LTBP3Q9NS15 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LTBP3Q9NS15 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LTBP3Q9NS15 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LTBP3Q9NS15 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LTBP3Q9NS15 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LTBP3Q9NS15 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LTBP3Q9NS15 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LTBP3Q9NS15 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LTBP3Q9NS15 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
LTBP3Q9NS15 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LTBP3Q9NS15 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LTBP3Q9NS15 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LTBP3Q9NS15 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LTBP3Q9NS15 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LTBP3Q9NS15 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
LTBP3Q9NS15 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
LTBP3Q9NS15 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LTBP3Q9NS15 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LTBP3Q9NS15 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LTBP3Q9NS15 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LTBP3Q9NS15 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LTBP3Q9NS15 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LTBP3Q9NS15 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LTBP3Q9NS15 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LTBP3Q9NS15 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
LTBP3Q9NS15 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LTBP3Q9NS15 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LTBP3Q9NS15 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LTBP3Q9NS15 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LTBP3Q9NS15 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LTBP3Q9NS15 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LTBP3Q9NS15 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LTBP3Q9NS15 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LTBP3Q9NS15 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LTBP3Q9NS15 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LTBP3Q9NS15 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LTBP3Q9NS15 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LTBP3Q9NS15 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LTBP3Q9NS15 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LTBP3Q9NS15 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LTBP3Q9NS15 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LTBP3Q9NS15 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LTBP3Q9NS15 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LTBP3Q9NS15 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LTBP3Q9NS15 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LTBP3Q9NS15 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LTBP3Q9NS15 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LTBP3Q9NS15 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LTBP3Q9NS15 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LTBP3Q9NS15 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LTBP3Q9NS15 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LTBP3Q9NS15 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LTBP3Q9NS15 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LTBP3Q9NS15 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LTBP3Q9NS15 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
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