Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TULP4Q9NRJ4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TULP4Q9NRJ4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TULP4Q9NRJ4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
TULP4Q9NRJ4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TULP4Q9NRJ4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TULP4Q9NRJ4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TULP4Q9NRJ4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TULP4Q9NRJ4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TULP4Q9NRJ4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TULP4Q9NRJ4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TULP4Q9NRJ4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TULP4Q9NRJ4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TULP4Q9NRJ4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TULP4Q9NRJ4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
TULP4Q9NRJ4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
TULP4Q9NRJ4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
TULP4Q9NRJ4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
TULP4Q9NRJ4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
TULP4Q9NRJ4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
TULP4Q9NRJ4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TULP4Q9NRJ4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TULP4Q9NRJ4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TULP4Q9NRJ4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TULP4Q9NRJ4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
TULP4Q9NRJ4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TULP4Q9NRJ4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TULP4Q9NRJ4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TULP4Q9NRJ4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TULP4Q9NRJ4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TULP4Q9NRJ4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TULP4Q9NRJ4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TULP4Q9NRJ4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TULP4Q9NRJ4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
TULP4Q9NRJ4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TULP4Q9NRJ4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TULP4Q9NRJ4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TULP4Q9NRJ4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TULP4Q9NRJ4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TULP4Q9NRJ4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TULP4Q9NRJ4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
TULP4Q9NRJ4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TULP4Q9NRJ4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TULP4Q9NRJ4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TULP4Q9NRJ4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TULP4Q9NRJ4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TULP4Q9NRJ4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TULP4Q9NRJ4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
TULP4Q9NRJ4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TULP4Q9NRJ4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TULP4Q9NRJ4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TULP4Q9NRJ4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TULP4Q9NRJ4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
TULP4Q9NRJ4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC32.26■■■□□ 2.76
TULP4Q9NRJ4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TULP4Q9NRJ4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TULP4Q9NRJ4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TULP4Q9NRJ4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TULP4Q9NRJ4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
TULP4Q9NRJ4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TULP4Q9NRJ4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TULP4Q9NRJ4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TULP4Q9NRJ4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TULP4Q9NRJ4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TULP4Q9NRJ4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TULP4Q9NRJ4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TULP4Q9NRJ4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TULP4Q9NRJ4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TULP4Q9NRJ4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TULP4Q9NRJ4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TULP4Q9NRJ4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
TULP4Q9NRJ4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
TULP4Q9NRJ4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TULP4Q9NRJ4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TULP4Q9NRJ4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TULP4Q9NRJ4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TULP4Q9NRJ4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TULP4Q9NRJ4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TULP4Q9NRJ4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TULP4Q9NRJ4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TULP4Q9NRJ4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TULP4Q9NRJ4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TULP4Q9NRJ4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TULP4Q9NRJ4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TULP4Q9NRJ4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TULP4Q9NRJ4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TULP4Q9NRJ4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TULP4Q9NRJ4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TULP4Q9NRJ4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TULP4Q9NRJ4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TULP4Q9NRJ4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TULP4Q9NRJ4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TULP4Q9NRJ4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
TULP4Q9NRJ4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
TULP4Q9NRJ4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
TULP4Q9NRJ4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
TULP4Q9NRJ4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
TULP4Q9NRJ4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TULP4Q9NRJ4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TULP4Q9NRJ4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms