Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ3

CCL28, C-C motif chemokine 28, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28Q9NRJ3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCL28Q9NRJ3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms