Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTPS2Q9NRF8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms