Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ36

SCUBE2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE2Q9NQ36 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCUBE2Q9NQ36 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCUBE2Q9NQ36 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SCUBE2Q9NQ36 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCUBE2Q9NQ36 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCUBE2Q9NQ36 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCUBE2Q9NQ36 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCUBE2Q9NQ36 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCUBE2Q9NQ36 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCUBE2Q9NQ36 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCUBE2Q9NQ36 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCUBE2Q9NQ36 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCUBE2Q9NQ36 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCUBE2Q9NQ36 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCUBE2Q9NQ36 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCUBE2Q9NQ36 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCUBE2Q9NQ36 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCUBE2Q9NQ36 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCUBE2Q9NQ36 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCUBE2Q9NQ36 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCUBE2Q9NQ36 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCUBE2Q9NQ36 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCUBE2Q9NQ36 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCUBE2Q9NQ36 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCUBE2Q9NQ36 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCUBE2Q9NQ36 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCUBE2Q9NQ36 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCUBE2Q9NQ36 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCUBE2Q9NQ36 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCUBE2Q9NQ36 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCUBE2Q9NQ36 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCUBE2Q9NQ36 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCUBE2Q9NQ36 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCUBE2Q9NQ36 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCUBE2Q9NQ36 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCUBE2Q9NQ36 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCUBE2Q9NQ36 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCUBE2Q9NQ36 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCUBE2Q9NQ36 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCUBE2Q9NQ36 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCUBE2Q9NQ36 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCUBE2Q9NQ36 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCUBE2Q9NQ36 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCUBE2Q9NQ36 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCUBE2Q9NQ36 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCUBE2Q9NQ36 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCUBE2Q9NQ36 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms