Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB3

CABP2, Calcium-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP2Q9NPB3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CABP2Q9NPB3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CABP2Q9NPB3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CABP2Q9NPB3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CABP2Q9NPB3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CABP2Q9NPB3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CABP2Q9NPB3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CABP2Q9NPB3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
CABP2Q9NPB3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
CABP2Q9NPB3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC32.14■■■□□ 2.73
CABP2Q9NPB3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
CABP2Q9NPB3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CABP2Q9NPB3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CABP2Q9NPB3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CABP2Q9NPB3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CABP2Q9NPB3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CABP2Q9NPB3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CABP2Q9NPB3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CABP2Q9NPB3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CABP2Q9NPB3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CABP2Q9NPB3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CABP2Q9NPB3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CABP2Q9NPB3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
CABP2Q9NPB3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CABP2Q9NPB3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CABP2Q9NPB3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CABP2Q9NPB3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CABP2Q9NPB3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CABP2Q9NPB3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CABP2Q9NPB3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CABP2Q9NPB3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CABP2Q9NPB3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CABP2Q9NPB3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CABP2Q9NPB3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
CABP2Q9NPB3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
CABP2Q9NPB3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CABP2Q9NPB3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CABP2Q9NPB3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CABP2Q9NPB3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CABP2Q9NPB3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CABP2Q9NPB3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CABP2Q9NPB3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CABP2Q9NPB3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CABP2Q9NPB3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CABP2Q9NPB3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CABP2Q9NPB3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CABP2Q9NPB3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CABP2Q9NPB3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CABP2Q9NPB3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CABP2Q9NPB3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CABP2Q9NPB3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CABP2Q9NPB3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CABP2Q9NPB3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CABP2Q9NPB3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CABP2Q9NPB3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CABP2Q9NPB3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CABP2Q9NPB3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CABP2Q9NPB3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CABP2Q9NPB3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CABP2Q9NPB3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CABP2Q9NPB3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CABP2Q9NPB3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
CABP2Q9NPB3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CABP2Q9NPB3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
CABP2Q9NPB3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CABP2Q9NPB3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CABP2Q9NPB3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CABP2Q9NPB3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
CABP2Q9NPB3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CABP2Q9NPB3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CABP2Q9NPB3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CABP2Q9NPB3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
CABP2Q9NPB3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CABP2Q9NPB3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CABP2Q9NPB3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CABP2Q9NPB3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CABP2Q9NPB3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CABP2Q9NPB3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CABP2Q9NPB3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CABP2Q9NPB3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CABP2Q9NPB3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CABP2Q9NPB3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CABP2Q9NPB3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CABP2Q9NPB3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CABP2Q9NPB3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CABP2Q9NPB3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
CABP2Q9NPB3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CABP2Q9NPB3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CABP2Q9NPB3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CABP2Q9NPB3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CABP2Q9NPB3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
CABP2Q9NPB3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CABP2Q9NPB3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CABP2Q9NPB3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CABP2Q9NPB3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CABP2Q9NPB3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CABP2Q9NPB3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CABP2Q9NPB3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CABP2Q9NPB3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CABP2Q9NPB3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms