Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB9BQ9NP90 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB9BQ9NP90 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB9BQ9NP90 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB9BQ9NP90 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB9BQ9NP90 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB9BQ9NP90 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB9BQ9NP90 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB9BQ9NP90 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB9BQ9NP90 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB9BQ9NP90 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB9BQ9NP90 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB9BQ9NP90 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB9BQ9NP90 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB9BQ9NP90 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB9BQ9NP90 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB9BQ9NP90 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB9BQ9NP90 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB9BQ9NP90 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB9BQ9NP90 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB9BQ9NP90 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB9BQ9NP90 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB9BQ9NP90 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB9BQ9NP90 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB9BQ9NP90 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB9BQ9NP90 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB9BQ9NP90 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB9BQ9NP90 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB9BQ9NP90 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB9BQ9NP90 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB9BQ9NP90 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB9BQ9NP90 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB9BQ9NP90 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB9BQ9NP90 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB9BQ9NP90 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms