Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP85

NPHS2, Podocin, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS2Q9NP85 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NPHS2Q9NP85 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.7 ms