Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms