Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP29Q9HBJ7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.8 ms