Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q4

NHEJ1, Non-homologous end-joining factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHEJ1Q9H9Q4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NHEJ1Q9H9Q4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NHEJ1Q9H9Q4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NHEJ1Q9H9Q4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NHEJ1Q9H9Q4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NHEJ1Q9H9Q4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NHEJ1Q9H9Q4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NHEJ1Q9H9Q4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NHEJ1Q9H9Q4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NHEJ1Q9H9Q4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NHEJ1Q9H9Q4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NHEJ1Q9H9Q4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NHEJ1Q9H9Q4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NHEJ1Q9H9Q4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NHEJ1Q9H9Q4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NHEJ1Q9H9Q4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms