Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNCQ9H7C4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNCQ9H7C4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNCQ9H7C4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNCQ9H7C4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNCQ9H7C4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNCQ9H7C4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNCQ9H7C4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNCQ9H7C4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNCQ9H7C4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNCQ9H7C4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNCQ9H7C4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNCQ9H7C4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNCQ9H7C4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNCQ9H7C4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNCQ9H7C4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNCQ9H7C4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNCQ9H7C4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNCQ9H7C4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNCQ9H7C4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNCQ9H7C4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNCQ9H7C4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNCQ9H7C4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNCQ9H7C4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNCQ9H7C4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNCQ9H7C4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNCQ9H7C4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNCQ9H7C4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNCQ9H7C4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNCQ9H7C4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNCQ9H7C4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNCQ9H7C4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNCQ9H7C4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNCQ9H7C4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNCQ9H7C4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNCQ9H7C4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNCQ9H7C4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNCQ9H7C4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNCQ9H7C4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNCQ9H7C4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNCQ9H7C4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNCQ9H7C4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNCQ9H7C4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNCQ9H7C4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNCQ9H7C4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNCQ9H7C4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNCQ9H7C4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNCQ9H7C4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNCQ9H7C4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNCQ9H7C4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNCQ9H7C4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNCQ9H7C4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNCQ9H7C4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYNCQ9H7C4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNCQ9H7C4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNCQ9H7C4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNCQ9H7C4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNCQ9H7C4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNCQ9H7C4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNCQ9H7C4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNCQ9H7C4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNCQ9H7C4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNCQ9H7C4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNCQ9H7C4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNCQ9H7C4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNCQ9H7C4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNCQ9H7C4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNCQ9H7C4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNCQ9H7C4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNCQ9H7C4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNCQ9H7C4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNCQ9H7C4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNCQ9H7C4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNCQ9H7C4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNCQ9H7C4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNCQ9H7C4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNCQ9H7C4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNCQ9H7C4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNCQ9H7C4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNCQ9H7C4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNCQ9H7C4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNCQ9H7C4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNCQ9H7C4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNCQ9H7C4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNCQ9H7C4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNCQ9H7C4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNCQ9H7C4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNCQ9H7C4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNCQ9H7C4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYNCQ9H7C4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYNCQ9H7C4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms